Ředitel
V čele krajského vojenského velitelství (KVV) je ředitel, který je přímo podřízen veliteli Teritoriálních sil.
Ředitel krajského vojenského velitelství je členem bezpečnostní rady kraje; je členem povodňové komise kraje; je krajským vojenským velitelem vojenského regionu; a v místech, kde sídlí regionální dislokační komise je členem této komise.
Velení
Zabezpečuje úkoly finančního a personálního zabezpečení pro krajské vojenské velitelství a příslušníky aktivní zálohy.
Voják v aktivní záloze zařazený v organizační struktuře krajského vojenského velitelství ve velení, v hodnosti stanovené pro toto služební místo, je připravován na funkci zástupce ředitele krajského vojenského velitelství a po dobu pravidelného vojenského cvičení realizuje opatření k zabezpečení výcviku aktivních záloh.
Vedoucí starší důstojník zařazený ve velení vykonává činnost pověřeného tiskového a informačního důstojníka a zodpovídá za oblast přípravy občanů k obraně státu (POKOS) v rámci teritoriální působnosti KVV.
Operační oddělení
Operační oddělení je organizační článek krajského vojenského velitelství pro zpracovávání, realizaci a vyhodnocování plánu činnosti krajského vojenského velitelství, pro střednědobé plánování, plánování a zabezpečení ochrany a obrany územního obvodu, zpracovávání a upřesňování plánu uvádění do bojové připravenosti, včetně zpracování dokumentace bojového (odborného) stmelení, plánování a provádění přípravy velitelů a štábu krajského vojenského velitelství, plánování a realizaci výcviku vojáků v aktivní záloze u krajského vojenského velitelství, plánování a organizování kontrolní a rozborové činnosti, pro plnění úkolů operační přípravy státního území a pro podporu procesů velení a řízení a jejich rozvoj, k zajištění realizace opatření bezpečnosti informačních a komunikačních systémů, ochrany informací a zabezpečení spisové služby. V čele operačního oddělení je vedoucí oddělení, který je přímo podřízen řediteli krajského vojenského velitelství a je nadřízen všem příslušníkům operačního oddělení.
Oddělení logistiky
Oddělení logistiky je organizační článek krajského vojenského velitelství pro řízení logistické podpory. V čele oddělení logistiky je vedoucí oddělení, který je přímo podřízen řediteli krajského vojenského velitelství a je nadřízen všem příslušníkům oddělení logistiky.
Oddělení obranných příprav
Oddělení obranných příprav je organizační článek krajského vojenského velitelství pro řízení a zabezpečení mobilizační pohotovosti, plánování a provedení mobilizace, řízení mobilizačních příprav, vedení evidence občanů České republiky, podléhajících branné povinnosti, evidence věcných prostředků pro doplnění ozbrojených sil České republiky, komplexní řízení a výstavbu jednotek aktivní zálohy, doplňování ozbrojených sil České republiky vojáky v záloze a věcnými prostředky po vyhlášení stavu ohrožení státu nebo válečného stavu, personální práci s vojáky v záloze, vydávání rozhodnutí ve správním řízení. V čele oddělení obranných příprav je vedoucí oddělení, který je přímo podřízen řediteli krajského vojenského velitelství a je nadřízen všem příslušníkům oddělení obranných příprav.
Oddělení odvodního řízení
Oddělení odvodního řízení je v době míru tvořeno vojáky v aktivní záloze, kteří jsou pravidelně připravováni na vojenských cvičeních k provádění odvodního řízení za stavu ohrožení státu nebo za válečného stavu. V čele oddělení odvodního řízení je vedoucí oddělení – voják v aktivní záloze, který je po dobu pravidelného vojenského cvičení přímo podřízen řediteli krajského vojenského velitelství a je nadřízen všem příslušníkům oddělení odvodního řízení – vojákům v aktivní záloze na pravidelném vojenském cvičení.